臨済宗南禅寺派の大本山で、京都五山のひとつに数えられています。 三門は2層からなり高さは22mあり、歌舞伎の中の石川五右衛門の台詞、「絶景かな、絶景 かな」で知られています。 国宝の方丈は、大方丈と小万丈からなっており、狩野元信や狩野探幽ら狩野派の筆による襖絵があります。大方丈前面 の庭園は俗に「虎の子渡しの庭」と呼ばれ、江戸初期の禅宗式 枯山水であり小堀遠州の作と伝えられています。

三門	本坊
	境内の南東には、疏水の流れる水路閣もみられます。
南禅院へ行く途中にある水路閣	南禅院へ行く途中にある水路閣
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